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生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展推動了診斷試劑向精準化、快速化、便攜化方向升級,其中核酸診斷試劑因直接靶向病原體或疾病相關(guān)基因,成為感染性疾病診斷、遺傳病篩查、腫瘤早篩等領域的核心產(chǎn)品。熒光定量PCR技術(shù)作為核酸檢測的“金標準”,其檢測性能直接決定診斷試劑的靈敏度、特異性及臨床適用性,而PCR儀的硬件性能是技術(shù)落地的關(guān)鍵支撐。
目前,國內(nèi)診斷試劑開發(fā)領域?qū)Ω咝阅?、高性價比的國產(chǎn)熒光定量PCR儀需求迫切。博清生物科技(南京)有限公司針對診斷試劑開發(fā)的核心痛點,研發(fā)了兼具精準性與實用性的熒光定量PCR儀,在光學設計、溫控精度、軟件適配性等方面進行專項優(yōu)化。
一、材料與方法
(一)實驗儀器
博清生物熒光定量PCR儀,配備多通道光學檢測系統(tǒng),溫控范圍4℃~100℃,升溫速率6℃/s,降溫速率6℃/s;進口儀器為某品牌熒光定量PCR儀。
(二)實驗材料
1、靶標核酸:新冠病毒(S基因)、甲型流感病毒(HA基因)、大腸桿菌(uidA基因)重組質(zhì)粒標準品(濃度梯度101~10?copies/μL)。
2、試劑耗材:PCR反應預混液(含Taq酶、dNTPs、熒光染料)、特異性引物探針(由生工生物合成)、無酶純水、臨床模擬樣本(滅活病毒液、細菌培養(yǎng)液、健康人血清)。
(三)實驗設計
1、反應體系優(yōu)化
以新冠病毒S基因為靶標,采用博清生物PCR儀,設置引物濃度(0.2~0.5μmol/L)、探針濃度(0.1~0.3μmol/L)、退火溫度(55~65℃)三因素三水平正交實驗,以Ct值、擴增效率(E)為評價指標,篩選最優(yōu)反應體系。
2、特異性驗證
選取新冠病毒、甲型流感病毒、大腸桿菌及人類管家基因(GAPDH)核酸樣本,使用優(yōu)化后的反應體系進行擴增,驗證儀器對特異性引物探針的識別能力。
3、靈敏度與線性范圍檢測
采用101~10?copies/μL的質(zhì)粒標準品,進行3次重復檢測,繪制標準曲線,計算線性相關(guān)系數(shù)(R2)、擴增效率,確定儀器的檢測下限(LOD)。
4、重復性評估
對103、10?、10?copies/μL三個濃度的標準品,分別進行批內(nèi)(n=8)和批間(n=3,連續(xù)3天)檢測,計算Ct值的變異系數(shù)(CV)。
5、臨床樣本適配性驗證
使用優(yōu)化后的診斷試劑配方,對50份臨床模擬樣本(含25份陽性樣本、25份陰性樣本)進行檢測,對比博清生物PCR儀與進口儀器的檢測一致性。
二、結(jié)果與分析
(一)反應體系優(yōu)化結(jié)果
正交實驗顯示,當引物濃度0.3μmol/L、探針濃度0.2μmol/L、退火溫度60℃時,擴增效果最佳。此時Ct值平均為22.3±0.5,擴增效率E=98.7%,符合診斷試劑開發(fā)的效率要求(90%~110%)。博清生物PCR儀的精準溫控能力的體現(xiàn),可快速鎖定最優(yōu)退火溫度,縮短體系優(yōu)化周期。
(二)特異性驗證結(jié)果
僅靶標核酸樣本出現(xiàn)特異性擴增曲線,非靶標樣本及空白對照均無擴增信號,交叉反應率為0。表明該儀器的光學檢測系統(tǒng)可有效區(qū)分特異性熒光信號與背景噪音,保障診斷試劑的特異性。
(三)靈敏度與線性范圍
標準曲線分析顯示,在101~10?copies/μL濃度范圍內(nèi),R2=0.999,擴增效率E=99.2%。檢測下限(LOD)為101copies/μL,與進口儀器檢測結(jié)果一致,滿足臨床診斷試劑對低濃度樣本的檢出需求。
(四)重復性表現(xiàn)
批內(nèi)檢測CV值為1.2%~2.5%,批間檢測CV值為1.8%~2.8%,均低于3%的行業(yè)標準。說明博清生物PCR儀的溫控穩(wěn)定性和光學檢測一致性良好,可保障診斷試劑批間差異控制在合理范圍。
(五)臨床樣本適配性
50份臨床模擬樣本檢測中,博清生物PCR儀與進口儀器的陽性檢出率均為100%,陰性符合率100%,一致性kappa值=1.0。表明該儀器可適配臨床樣本基質(zhì),滿足診斷試劑臨床驗證階段的檢測需求。
三、討論
診斷試劑開發(fā)的核心訴求是兼顧性能可靠性與開發(fā)效率,而PCR儀的硬件性能直接影響試劑配方優(yōu)化、性能驗證的周期與效果。博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)的熒光定量PCR儀在本次實驗中展現(xiàn)出三大核心優(yōu)勢:
首先,精準的溫控系統(tǒng)與多通道光學設計,保障了反應體系優(yōu)化的高效性和特異性驗證的準確性。其快速升降溫能力可將單次擴增周期縮短至40分鐘內(nèi),相比傳統(tǒng)儀器提升30%效率,顯著加快試劑開發(fā)進程。
其次,寬線性范圍與高靈敏度,可覆蓋從低濃度病原體檢測到高濃度樣本定量的全場景需求,適用于感染性疾病早期診斷、療效監(jiān)測等不同用途的試劑開發(fā)。
最后,良好的兼容性與重復性,使其可適配市面上主流的PCR預混液、引物探針,且批間差異小,為診斷試劑的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)提供了穩(wěn)定的檢測平臺。
與進口儀器相比,博清生物熒光定量PCR儀在核心性能指標上已實現(xiàn)持平,且在軟件操作的本土化適配、售后響應速度等方面更具優(yōu)勢,可降低國內(nèi)診斷試劑企業(yè)的開發(fā)成本與技術(shù)門檻。
博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)的熒光定量PCR儀憑借精準的溫控性能、高靈敏度的光學檢測系統(tǒng)及良好的兼容性,可高效適配診斷試劑開發(fā)的全流程,包括反應體系優(yōu)化、特異性驗證、靈敏度標定及臨床樣本驗證。其核心性能達到行業(yè)先進水平,能為生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)中核酸診斷試劑的快速開發(fā)與產(chǎn)業(yè)化提供可靠技術(shù)支撐,助力國產(chǎn)診斷試劑的自主創(chuàng)新與市場推廣。未來可進一步拓展儀器在數(shù)字PCR、多重檢測等高端應用場景的適配性,滿足更復雜的診斷試劑開發(fā)需求。
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